湖南舜皇山自然保护区优越的水热条件，茂密的森林生态环境，为大型真菌的生长繁殖提供了适宜的场所。据考察自然保护区内共有大型真菌203种，隶属于20目41科96属，其中全国新记录1种，湖南新记录77种。在这些形形色色的大型真菌中，有57种具食用价值，38种有药用价值，24种与不同树木形成外生菌根，105种木材致腐菌，19种有毒菌类。它们与森林植物、动物一道形成了多样的森林生态系统，它们分解森林中的凋谢物，为许多昆虫动物提供食源，是森林生态系统中物质循环不可缺少的一个类群，在食用菌与药用菌及有毒菌体中所蕴含的丰富基因，是人类生存不可或缺的基因库。