自然保护区的水平地带性土壤是红壤。土壤的形成主要受复杂的地形地貌，垂直分布的生物气候及不同植被类型的影响，并且由于自然景观的复杂多样加上东西坡自然条件的差异明显，使各土类之间交错分布和镶嵌的现象较普遍，成为保护区土壤多样性的一个具体表现。保护区土壤主要是以花岗岩和板页岩发育而成的山地红壤和山地黄壤。土壤的垂直分布差异明显，分为山地红壤、山地黄红壤、山地黄壤、山地黄棕壤、山地草甸土等5个土壤亚类。